Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R9

Taf7l, Transcription initiation factor TFIID subunit 7-like, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7lQ9D3R9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf7lQ9D3R9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf7lQ9D3R9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms