Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc6bQ9D289 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc6bQ9D289 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms