Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl53Q9D1H8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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