Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc3Q9D114 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc3Q9D114 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms