Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms