Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxxc1Q9CWW7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxxc1Q9CWW7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms