Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcf1Q9CTH6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcf1Q9CTH6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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