Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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