Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE3

Mrps17, 28S ribosomal protein S17, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps17Q9CQE3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrps17Q9CQE3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrps17Q9CQE3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms