Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl39lQ9CQD0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl39lQ9CQD0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl39lQ9CQD0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpl39lQ9CQD0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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