Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Use1Q9CQ56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Use1Q9CQ56 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Use1Q9CQ56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Use1Q9CQ56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Use1Q9CQ56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms