Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StambpQ9CQ26 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms