Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms