Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL3Q9BXA9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms