Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms