Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf2Q99LE6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms