Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf34Q99KR6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms