Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlgn1Q99K10 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlgn1Q99K10 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms