Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Def8Q99J78 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms