Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms