Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b5Q923D4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms