Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx18Q91ZR2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx18Q91ZR2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms