Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atl3Q91YH5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms