Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms