Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alg12Q8VDB2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg12Q8VDB2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms