Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmx1Q8VBT0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmx1Q8VBT0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmx1Q8VBT0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmx1Q8VBT0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmx1Q8VBT0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmx1Q8VBT0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmx1Q8VBT0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms