Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf3Q8R3J4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms