Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nsl1Q8K305 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsl1Q8K305 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms