Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2U2

Alkbh6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh6Q8K2U2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh6Q8K2U2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh6Q8K2U2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh6Q8K2U2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alkbh6Q8K2U2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh6Q8K2U2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alkbh6Q8K2U2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh6Q8K2U2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms