Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem17Q8K0U3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem17Q8K0U3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms