Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms