Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnka2ipQ8CH19 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnka2ipQ8CH19 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms