Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx8Q8CFD4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx8Q8CFD4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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