Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms