Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp27Q8CEG8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp27Q8CEG8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp27Q8CEG8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp27Q8CEG8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp27Q8CEG8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp27Q8CEG8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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