Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo48Q8CAT8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo48Q8CAT8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms