Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm9999Q8C5Y2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm9999Q8C5Y2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm9999Q8C5Y2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm9999Q8C5Y2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm9999Q8C5Y2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm9999Q8C5Y2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9999Q8C5Y2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9999Q8C5Y2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms