Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Vash1Q8C1W1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vash1Q8C1W1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms