Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh12Q8BYK4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh12Q8BYK4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms