Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms