Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vipas39Q8BGQ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms