Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pknox2Q8BG99 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pknox2Q8BG99 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms