Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnb1Q8BG40 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnb1Q8BG40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms