Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG30

Nelfa, Negative elongation factor A, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfaQ8BG30 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfaQ8BG30 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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