Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf7ipQ7TT18 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf7ipQ7TT18 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf7ipQ7TT18 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms