Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg1cQ7TSF0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms