Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms