Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mfsd13aQ6PDE8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms