Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6PD19 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q6PD19 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6PD19 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6PD19 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6PD19 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6PD19 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms