Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bend3Q6PAL0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bend3Q6PAL0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms